영국 연구자들은 시간이 지남에 따라 줄어들기를 희망하는 새로운 공개적으로 접근 가능한 데이터베이스를 개발했습니다. 그 이유는 데이터베이스가 인간 게놈의 유전자에 의해 암호화된 수천 개의 연구되지 않은 단백질을 통합하기 때문입니다. 그 존재는 알려져 있지만 기능은 대부분 알려지지 않았습니다.
"Unnome"이라고 불리는 이 데이터베이스는 영국 옥스퍼드 대학 던 병리학부의 매튜 프리먼(Matthew Freeman)과 영국 케임브리지에 있는 MRC 분자생물학 연구소의 션 먼로(Sean Munro)와 동료들의 연구 결과입니다. 그들은 데이터베이스의 일부 단백질을 연구한 결과 대부분이 발달 및 스트레스 저항성을 포함한 중요한 세포 기능에 기여한다는 것을 발견했습니다.
인간 게놈의 서열 분석은 인간 게놈이 오늘날까지 그 정체와 기능이 알려지지 않은 수천 개의 가능한 단백질 서열을 암호화한다는 것을 분명히 보여주었습니다. 그 이유는 알려진 표적에 부족한 연구 자금을 집중시키는 경향과 세포에서 이러한 단백질의 기능을 연구하기 위한 항체를 포함한 도구의 부족을 포함하여 다원적입니다.
그러나 저자들은 이러한 단백질을 무시하는 것은 위험하다고 생각합니다. 왜냐하면 일부 단백질(아마도 다수)이 주요 세포 과정에서 중요한 역할을 하고 통찰력을 제공하고 치료 개입의 표적으로 작용할 수 있기 때문입니다.
이러한 종류의 단백질을 보다 신속하게 탐색하기 위해 저자는 기능, 종간 보존, 세포 이하 구획화 및 기타 요소에 관한 과학 문헌의 정보를 반영하는 "알림" 점수를 각 단백질에 할당하는 Unknome 데이터베이스를 만들었습니다.
이 시스템에 따르면, "알려진 정도"가 0에 가까운 수천 개의 단백질이 있습니다. 여기에는 모델 유기체의 단백질뿐만 아니라 인간 게놈의 단백질도 포함됩니다. 데이터베이스는 모든 사람에게 공개되고 사용자 정의가 가능하므로 사용자는 다양한 요소에 대해 자신만의 가중치를 제공하고 자신만의 연구 우선 순위를 지정하기 위한 자신만의 알려진 점수 세트를 생성할 수 있습니다.
데이터베이스의 유용성을 테스트하기 위해 저자는 초파리와 유사한 유전자를 가지고 있고 두 종 모두에서 알려진 점수가 1 이하인 인간의 유전자 260개를 선택했는데, 이는 이들에 대해 알려진 것이 거의 없음을 나타냅니다. 이들 유전자 중 상당수가 완전히 녹아웃되면 파리의 생명과 양립할 수 없습니다. 부분적 또는 조직 특이적 녹아웃을 통해 대부분의 유전자가 생식력, 발달, 조직 성장, 단백질 품질 관리 또는 스트레스 저항성에 영향을 미치는 중요한 기능에 기여한다는 사실이 밝혀졌습니다.
이번 연구 결과는 수십 년간의 상세한 연구에도 불구하고 수천 개의 파리 유전자가 가장 기본적인 수준에서도 이해되지 않은 채로 남아 있으며 인간 게놈의 경우에도 마찬가지라는 점을 보여줍니다. "이러한 특성화되지 않은 유전자는 무시되어서는 안됩니다"라고 Munro는 말했습니다. "우리의 데이터베이스는 분석을 위해 알려지지 않은 기능의 중요한 유전자를 식별하고 선택하기 위한 강력하고 다재다능하며 효율적인 플랫폼을 제공하여 알려지지 않은 게놈으로 대표되는 생물학적 지식 격차를 줄이는 것을 가속화합니다." "
Munro는 "수천 가지 인간 단백질의 역할은 불분명하지만 연구는 이미 잘 알려진 단백질에 초점을 맞추는 경향이 있습니다. 이 문제를 해결하기 위해 우리는 'Unknome' 데이터베이스를 만들었습니다. 이 데이터베이스는 단백질이 얼마나 잘 알려져 있는지에 따라 순위를 매긴 다음 이러한 신비한 단백질의 하위 집합을 기능적으로 선별하여 무지가 생물학적 발견을 어떻게 주도하는지 보여줍니다."라고 덧붙였습니다.